1956年12月，河南省郑州卫生学校迁至郑州市纬五路东段，更名为河南省郑州第一卫生学校，增设药剂士专业，学制三年，是河南省最早设立的药学专业。这是河南大学药学院药学专业的前身。
1958年6月，经河南省人民政府批准，河南省郑州第一卫生学校升格为大学专科，更名为河南省医药专科学校，设医疗、药学2个专业。
1959年2月，河南省文教部决定，河南省医药专科学校迁至开封，更名为开封医药专科学校。
1984年，开封医药专科学校药学专业改建为药学系。
1992年，开封医药专科学校更名为开封医学高等专科学校。
2000年7月，开封医学高等专科学校与河南大学合并，开封医学高等专科学校药学系更名为河南大学医学院药学系。
2001年4月，河南大学医学院药学系改建为河南大学药学院，开始药学本科教育。2003年，获批硕士学位授予点。2015年获批药物系统生物学二级学科博士学位授权点。
2016年10月，更名为河南大学医学院药学院。
2024年10月，获批药学一级学科博士学位授权点。
学院现有教职工101人，专任教师81人，教授31人，副教授33人，博士74人。其中，国际欧亚科学院院士1人，国家级人才4人，国家重点研发计划青年项目首席科学家1人，河南省特聘教授2人，河南省学术科技带头人1人，河南省杰青2人，河南省优青3人，中原科技创新青年拔尖人才3人，河南省创新人才1人，河南省高校科技创新人才3人，河南省教育厅学术技术带头人7人；受聘河南大学“杰出人才特区支持计划”第二层次特聘教授2人，至善特聘教授领军人才1人，“杰出人才特区支持计划”第四层次特聘教授2人。目前，学院共有全日制在校生1326人，其中本科生810人，博士及硕士研究生516人，生源覆盖全国27个省（直辖市、自治区）；继续教育学生1000余人。
学院拥有药学一级学科博士学位授权点，药学、中药学一级学科硕士学位授权点，药学、中药学专业学位硕士授权点。设有药学、中药学、临床药学三个本科专业，药学专业为国家一流本科专业建设点，中药学、临床药学专业为河南省一流本科专业建设点。建有抗病毒性传染病创新药物全国重点实验室、河南省天然药物创新与转化重点实验室、河南省心脏电生理重点实验室、河南省小分子抗肿瘤创新药重点实验室、河南省脑靶向生物纳米药物重点实验室，以及河南省黄河流域特色药用资源高值化利用工程研究中心、河南省药品监管科学研究基地、河南省中药药效国际联合实验室等一批省级平台。药理学与毒理学ESI排名进入全球前5‰，药学学科软科排名位于前33%。近年来，在国际欧亚科学院院士杜冠华院长的带领下，学院聚焦原始创新，重视交叉融合，结合地方特色，对接河南省生物医药技术与产业发展需求，在肿瘤和心脑血管疾病创新药物与作用机制研究、基于天然产物的新型药物递送系统构建等方面形成一定的特色与优势。
学院构建了“产学研用”深度融合的创新人才培养体系，为学生提供优质实践平台和实训机会。学院设有泰丰奖学金、常乐制药奖学金、羚锐奖学金、新春都张劭药学人才奖学金、菲力康创新创业奖学金等企业奖学金，为学生实现人生梦想保驾护航。近年来，学院本科生考研升学率稳居学校前列，学生就业率屡创新高，连续五年荣获“河南大学就业工作先进单位”、“河南大学创新创业工作先进单位”。15000多名校友遍布海内外，众多校友已成为药政及医疗卫生系统骨干、知名药企高管、科研领军人才和创新创业先锋，为“健康中国”和“健康中原”事业作出重要贡献。
学院以习·近·平新时代中国特色社会主义思想为指导，牢牢把握“强理振文、新工新医”办学新主线，积极弘扬“自信、拼搏、开放、创新”新河大精神，精诚团结、锐意进取，以高质量党建引领学院高质量发展，为学校的“双一流”“双航母”建设贡献力量。
（2025年6月更新）
