1956年12月，河南省郑州卫生学校迁至郑州市纬五路东段，更名为河南省郑州第一卫生学校，增设药剂士专业，学制三年。这是河南大学药学院药学专业的前身。
1958年6月，经河南省人民政府批准，河南省郑州第一卫生学校升格为大学专科，更名为河南省医药专科学校，设医疗、药学2个专业。
1959年2月，河南省文教部决定，河南省医药专科学校迁至开封，更名为开封医药专科学校。
1984年，开封医药专科学校药学专业改建为药学系。
1992年，开封医药专科学校更名为开封医学高等专科学校。
2000年7月，开封医学高等专科学校与河南大学合并，开封医学高等专科学校药学系更名为河南大学医学院药学系。
2001年4月，河南大学医学院药学系改建为河南大学药学院，开始药学本科教育。2003年，获批硕士学位授予点。2015年获批博士学位授权点。
2016年10月，更名为河南大学医学院药学院。
经过近70年发展，药学院已成为中国教育学会药学教育分会常务理事单位、全国杜仲产业技术创新战略联盟副理事长单位，中华中医药学会中药教育专业委员会副秘书长单位，河南省药学会副理事长单位，河南省药学会中药资源专业委员会主任委员单位，河南省执业药师协会副会长单位。
学院现有教职工103人，其中教授32人，副教授30人，博士72人，其中欧亚科学院院士1人、国家级高层次人才3人；河南省特聘教授2人；河南大学第四层次人才特聘教授3人、黄河学者特聘教授2人、校特聘教授1人、“百人计划”1人、“青年英才“2人；国家新药评审专家7人、国家保健食品和化妆品评审专家7人、国家执业药师工作专家5人、河南省执业药师工作专家5人；河南省学术技术带头人1人、河南省创新人才1人、河南省杰青1人、河南省优青2人、河南省高校创新人才2人、河南省教育厅学术技术带头人7人。目前，在校全日制本科生800多人，来自27个省（直辖市）、自治区；在校博士、硕士研究生500多人；在校成人教育学生800余人。
学院设有药学、中药学、临床药学3个本科专业。2021年，药学专业入选国家一流本科专业建设点。拥有药理学、天然药物化学、生药学、生物化学、药事管理学等省、校级教学质量工程项目35项。设有9个教研室、教学实验室和科研实验室等2个实验室、分析测试中心。
学院拥有药学一级学科博士学位授权点，药物系统生物学二级学科博士学位授权点；药学、中药学一级学科硕士学位授权点，药学、中药学专业学位硕士授权点。2017年4月，中药学专业顺利通过教育部中药学类专业教学指导委员会组织的专业认证。中药学、药学为河南省重点一级学科。中药药效物质与创新药物研究团队、药食两用资源研究开发团队等两个团队为河南省高校创新团队。
学院建有国家级平台：抗病毒性传染病创新药物全国重点实验室；省实验室：中州实验室；省级平台：河南省脑靶向生物纳米药物重点实验室、河南省心脏电生理重点实验室、河南省小分子抗肿瘤创新药重点实验室、河南省黄河流域特色天然药用资源高值化利用工程研究中心、河南省药品监管科学研究基地、河南省中药药效国际联合实验室、中央与地方共建高校特色优势学科药物制剂实验室、河南省药物物质基础重点实验室（培育）、河南省高校杜仲栽培与利用工程技术研究中心、河南省药学实验教学示范中心、河南省中药学虚拟仿真实验教学中心等；市级平台：开封菊花药食功效开发开封市重点实验室。
学院治学态度严谨，学术氛围浓郁。五年来，先后承担国家重点研发计划、国家自然科学基金、国家科技支撑计划、国家行业性公益专项、国家中药标准化项目、创新药物等国家级课题53项。发表论文300多篇，其中SCI 200多篇，出版论著32部，授权发明专利35项，获得各类科研教学奖励62项。注重提升服务地方经济社会发展能力，坚持政产学研用有机结合，横向项目总金额近千万元，杜仲、菊花、连翘、辛夷等深加工项目已成为区域经济科学发展、农民增收的重要支柱，彰显了学院的专业优势和社会服务能力。
学院设有泰丰奖学金、助梦奖学金、新春都药学人才奖学金、常乐制药奖学金等企业奖学金。坚持文化育人、实践育人，培养应用型、创新型、复合型人才，毕业生动手能力强、综合素质高。多年来，本科生考研升学率达50％，就业率稳定在98%左右。涌现出原河南省药监局局长张泽书，河南泰丰集团董事长徐攀峰，扬子江药业集团广州公司总经理臧鑫炎等一大批中高级医药行业经营管理人才和业务骨干。13000多名校友遍布海内外。
（2024年10月更新）
